Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms