Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCBP1Q09161 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms