Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms