Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms