Protein–RNA interactions for Protein: Q07960

ARHGAP1, Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP1Q07960 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms