Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms