Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ID3Q02535 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ID3Q02535 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ID3Q02535 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ID3Q02535 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ID3Q02535 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ID3Q02535 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ID3Q02535 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ID3Q02535 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ID3Q02535 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ID3Q02535 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ID3Q02535 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ID3Q02535 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ID3Q02535 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ID3Q02535 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ID3Q02535 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ID3Q02535 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ID3Q02535 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ID3Q02535 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ID3Q02535 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ID3Q02535 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ID3Q02535 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ID3Q02535 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ID3Q02535 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID3Q02535 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID3Q02535 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID3Q02535 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID3Q02535 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID3Q02535 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ID3Q02535 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID3Q02535 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID3Q02535 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID3Q02535 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID3Q02535 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID3Q02535 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID3Q02535 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID3Q02535 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID3Q02535 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ID3Q02535 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID3Q02535 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID3Q02535 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ID3Q02535 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID3Q02535 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ID3Q02535 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID3Q02535 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID3Q02535 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID3Q02535 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID3Q02535 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID3Q02535 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID3Q02535 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID3Q02535 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ID3Q02535 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID3Q02535 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID3Q02535 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID3Q02535 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ID3Q02535 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ID3Q02535 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ID3Q02535 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ID3Q02535 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ID3Q02535 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ID3Q02535 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ID3Q02535 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ID3Q02535 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ID3Q02535 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ID3Q02535 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ID3Q02535 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ID3Q02535 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ID3Q02535 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ID3Q02535 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ID3Q02535 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ID3Q02535 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ID3Q02535 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ID3Q02535 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ID3Q02535 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ID3Q02535 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ID3Q02535 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ID3Q02535 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ID3Q02535 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ID3Q02535 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ID3Q02535 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ID3Q02535 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ID3Q02535 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ID3Q02535 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ID3Q02535 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ID3Q02535 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID3Q02535 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID3Q02535 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID3Q02535 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID3Q02535 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID3Q02535 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID3Q02535 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID3Q02535 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID3Q02535 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID3Q02535 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID3Q02535 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ID3Q02535 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID3Q02535 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID3Q02535 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ID3Q02535 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID3Q02535 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms