Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms