Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms