Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms