Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms