Protein–RNA interactions for Protein: Q00005

PPP2R2B, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R2BQ00005 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP2R2BQ00005 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP2R2BQ00005 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms