Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCNA1P78396 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms