Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms