Protein–RNA interactions for Protein: P60174

TPI1, Triosephosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1P60174 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPI1P60174 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPI1P60174 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPI1P60174 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPI1P60174 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPI1P60174 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPI1P60174 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPI1P60174 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPI1P60174 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPI1P60174 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPI1P60174 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPI1P60174 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPI1P60174 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPI1P60174 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPI1P60174 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPI1P60174 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPI1P60174 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPI1P60174 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPI1P60174 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPI1P60174 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPI1P60174 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPI1P60174 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPI1P60174 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPI1P60174 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPI1P60174 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPI1P60174 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPI1P60174 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPI1P60174 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPI1P60174 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPI1P60174 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPI1P60174 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPI1P60174 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPI1P60174 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPI1P60174 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPI1P60174 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TPI1P60174 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPI1P60174 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPI1P60174 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPI1P60174 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TPI1P60174 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TPI1P60174 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPI1P60174 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPI1P60174 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPI1P60174 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPI1P60174 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPI1P60174 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPI1P60174 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TPI1P60174 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPI1P60174 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPI1P60174 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPI1P60174 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPI1P60174 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPI1P60174 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPI1P60174 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPI1P60174 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TPI1P60174 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPI1P60174 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPI1P60174 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPI1P60174 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPI1P60174 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPI1P60174 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPI1P60174 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPI1P60174 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPI1P60174 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPI1P60174 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPI1P60174 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPI1P60174 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPI1P60174 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPI1P60174 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPI1P60174 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPI1P60174 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPI1P60174 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPI1P60174 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPI1P60174 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPI1P60174 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPI1P60174 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPI1P60174 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPI1P60174 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPI1P60174 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPI1P60174 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPI1P60174 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPI1P60174 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPI1P60174 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPI1P60174 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPI1P60174 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPI1P60174 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPI1P60174 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPI1P60174 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPI1P60174 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPI1P60174 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPI1P60174 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPI1P60174 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPI1P60174 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPI1P60174 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPI1P60174 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPI1P60174 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPI1P60174 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TPI1P60174 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPI1P60174 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPI1P60174 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms