Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CABP4P57796 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CABP4P57796 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CABP4P57796 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CABP4P57796 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CABP4P57796 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CABP4P57796 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CABP4P57796 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CABP4P57796 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CABP4P57796 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CABP4P57796 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CABP4P57796 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CABP4P57796 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CABP4P57796 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CABP4P57796 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CABP4P57796 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CABP4P57796 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CABP4P57796 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CABP4P57796 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CABP4P57796 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CABP4P57796 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CABP4P57796 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CABP4P57796 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CABP4P57796 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CABP4P57796 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CABP4P57796 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CABP4P57796 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CABP4P57796 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CABP4P57796 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CABP4P57796 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CABP4P57796 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CABP4P57796 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CABP4P57796 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CABP4P57796 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CABP4P57796 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CABP4P57796 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CABP4P57796 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CABP4P57796 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CABP4P57796 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CABP4P57796 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CABP4P57796 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CABP4P57796 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CABP4P57796 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CABP4P57796 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CABP4P57796 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CABP4P57796 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CABP4P57796 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CABP4P57796 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CABP4P57796 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CABP4P57796 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CABP4P57796 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CABP4P57796 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CABP4P57796 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CABP4P57796 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CABP4P57796 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CABP4P57796 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CABP4P57796 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CABP4P57796 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CABP4P57796 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CABP4P57796 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CABP4P57796 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CABP4P57796 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CABP4P57796 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CABP4P57796 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CABP4P57796 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CABP4P57796 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CABP4P57796 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CABP4P57796 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CABP4P57796 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CABP4P57796 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CABP4P57796 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CABP4P57796 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CABP4P57796 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CABP4P57796 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CABP4P57796 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CABP4P57796 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CABP4P57796 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CABP4P57796 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CABP4P57796 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CABP4P57796 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CABP4P57796 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CABP4P57796 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CABP4P57796 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CABP4P57796 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CABP4P57796 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CABP4P57796 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CABP4P57796 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CABP4P57796 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CABP4P57796 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CABP4P57796 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CABP4P57796 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CABP4P57796 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CABP4P57796 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CABP4P57796 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CABP4P57796 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CABP4P57796 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CABP4P57796 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CABP4P57796 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CABP4P57796 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CABP4P57796 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms