Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms