Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX2P50458 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX2P50458 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX2P50458 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX2P50458 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX2P50458 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX2P50458 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX2P50458 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX2P50458 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX2P50458 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX2P50458 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX2P50458 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX2P50458 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LHX2P50458 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX2P50458 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX2P50458 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX2P50458 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX2P50458 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX2P50458 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX2P50458 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX2P50458 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX2P50458 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX2P50458 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX2P50458 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX2P50458 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX2P50458 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX2P50458 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX2P50458 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX2P50458 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX2P50458 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX2P50458 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX2P50458 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX2P50458 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX2P50458 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX2P50458 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX2P50458 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX2P50458 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX2P50458 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LHX2P50458 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX2P50458 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX2P50458 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX2P50458 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX2P50458 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX2P50458 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX2P50458 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX2P50458 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX2P50458 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX2P50458 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX2P50458 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX2P50458 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX2P50458 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX2P50458 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX2P50458 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX2P50458 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX2P50458 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX2P50458 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX2P50458 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX2P50458 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX2P50458 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX2P50458 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX2P50458 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LHX2P50458 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX2P50458 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX2P50458 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX2P50458 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX2P50458 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX2P50458 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX2P50458 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX2P50458 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX2P50458 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX2P50458 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX2P50458 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX2P50458 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX2P50458 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX2P50458 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX2P50458 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX2P50458 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX2P50458 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX2P50458 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX2P50458 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX2P50458 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX2P50458 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX2P50458 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX2P50458 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX2P50458 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX2P50458 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX2P50458 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX2P50458 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX2P50458 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX2P50458 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX2P50458 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX2P50458 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX2P50458 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX2P50458 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX2P50458 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX2P50458 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX2P50458 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX2P50458 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX2P50458 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX2P50458 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms