Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTAP49354 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTAP49354 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTAP49354 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTAP49354 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTAP49354 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTAP49354 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTAP49354 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTAP49354 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTAP49354 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTAP49354 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTAP49354 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTAP49354 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTAP49354 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTAP49354 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTAP49354 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTAP49354 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTAP49354 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTAP49354 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTAP49354 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTAP49354 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTAP49354 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTAP49354 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTAP49354 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTAP49354 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTAP49354 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTAP49354 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTAP49354 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTAP49354 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTAP49354 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTAP49354 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTAP49354 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTAP49354 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTAP49354 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FNTAP49354 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNTAP49354 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNTAP49354 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNTAP49354 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNTAP49354 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNTAP49354 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNTAP49354 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNTAP49354 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNTAP49354 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNTAP49354 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNTAP49354 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNTAP49354 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNTAP49354 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FNTAP49354 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNTAP49354 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNTAP49354 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FNTAP49354 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FNTAP49354 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FNTAP49354 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FNTAP49354 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FNTAP49354 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FNTAP49354 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FNTAP49354 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FNTAP49354 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FNTAP49354 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTAP49354 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTAP49354 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTAP49354 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTAP49354 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTAP49354 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTAP49354 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTAP49354 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTAP49354 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTAP49354 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTAP49354 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTAP49354 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTAP49354 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTAP49354 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTAP49354 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTAP49354 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTAP49354 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTAP49354 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTAP49354 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTAP49354 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTAP49354 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTAP49354 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FNTAP49354 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTAP49354 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTAP49354 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTAP49354 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTAP49354 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTAP49354 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTAP49354 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTAP49354 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTAP49354 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTAP49354 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTAP49354 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTAP49354 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTAP49354 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTAP49354 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTAP49354 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTAP49354 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTAP49354 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTAP49354 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTAP49354 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTAP49354 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms