Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTDSS1P48651 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms