Protein–RNA interactions for Protein: P35913

PDE6B, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6BP35913 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE6BP35913 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE6BP35913 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE6BP35913 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE6BP35913 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms