Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms