Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2H1P32780 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H1P32780 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms