Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID4AP29374 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms