Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD34P28906 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD34P28906 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD34P28906 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD34P28906 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD34P28906 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD34P28906 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD34P28906 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD34P28906 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD34P28906 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD34P28906 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD34P28906 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD34P28906 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD34P28906 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CD34P28906 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD34P28906 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD34P28906 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD34P28906 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD34P28906 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD34P28906 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CD34P28906 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD34P28906 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD34P28906 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD34P28906 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD34P28906 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD34P28906 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD34P28906 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD34P28906 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD34P28906 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD34P28906 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD34P28906 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD34P28906 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD34P28906 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD34P28906 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD34P28906 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CD34P28906 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD34P28906 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD34P28906 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD34P28906 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD34P28906 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CD34P28906 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD34P28906 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CD34P28906 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD34P28906 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CD34P28906 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD34P28906 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD34P28906 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD34P28906 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD34P28906 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD34P28906 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD34P28906 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD34P28906 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD34P28906 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD34P28906 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD34P28906 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD34P28906 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD34P28906 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD34P28906 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD34P28906 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD34P28906 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD34P28906 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD34P28906 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD34P28906 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD34P28906 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms