Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
POLD1P28340 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLD1P28340 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLD1P28340 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLD1P28340 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLD1P28340 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLD1P28340 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLD1P28340 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLD1P28340 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLD1P28340 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLD1P28340 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
POLD1P28340 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLD1P28340 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
POLD1P28340 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLD1P28340 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLD1P28340 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLD1P28340 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLD1P28340 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLD1P28340 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
POLD1P28340 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLD1P28340 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLD1P28340 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLD1P28340 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLD1P28340 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLD1P28340 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
POLD1P28340 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
POLD1P28340 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLD1P28340 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLD1P28340 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
POLD1P28340 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLD1P28340 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLD1P28340 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
POLD1P28340 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLD1P28340 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLD1P28340 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLD1P28340 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLD1P28340 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLD1P28340 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLD1P28340 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLD1P28340 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLD1P28340 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLD1P28340 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLD1P28340 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLD1P28340 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLD1P28340 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLD1P28340 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
POLD1P28340 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLD1P28340 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
POLD1P28340 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLD1P28340 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLD1P28340 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLD1P28340 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLD1P28340 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLD1P28340 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLD1P28340 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLD1P28340 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLD1P28340 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLD1P28340 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLD1P28340 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLD1P28340 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
POLD1P28340 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLD1P28340 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLD1P28340 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLD1P28340 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
POLD1P28340 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLD1P28340 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLD1P28340 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
POLD1P28340 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLD1P28340 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLD1P28340 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLD1P28340 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLD1P28340 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLD1P28340 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLD1P28340 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
POLD1P28340 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLD1P28340 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLD1P28340 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLD1P28340 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLD1P28340 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLD1P28340 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
POLD1P28340 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLD1P28340 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLD1P28340 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLD1P28340 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLD1P28340 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLD1P28340 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLD1P28340 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLD1P28340 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLD1P28340 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLD1P28340 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLD1P28340 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
POLD1P28340 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLD1P28340 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLD1P28340 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLD1P28340 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
POLD1P28340 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
POLD1P28340 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLD1P28340 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
POLD1P28340 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
POLD1P28340 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms