Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTX3P26022 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTX3P26022 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTX3P26022 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTX3P26022 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTX3P26022 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTX3P26022 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTX3P26022 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTX3P26022 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTX3P26022 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTX3P26022 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTX3P26022 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTX3P26022 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTX3P26022 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTX3P26022 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTX3P26022 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTX3P26022 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTX3P26022 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTX3P26022 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTX3P26022 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTX3P26022 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTX3P26022 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTX3P26022 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTX3P26022 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTX3P26022 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTX3P26022 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTX3P26022 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTX3P26022 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTX3P26022 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTX3P26022 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTX3P26022 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTX3P26022 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTX3P26022 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTX3P26022 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTX3P26022 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTX3P26022 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTX3P26022 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTX3P26022 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTX3P26022 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTX3P26022 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTX3P26022 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTX3P26022 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTX3P26022 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTX3P26022 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTX3P26022 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTX3P26022 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTX3P26022 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTX3P26022 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTX3P26022 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTX3P26022 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTX3P26022 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTX3P26022 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTX3P26022 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTX3P26022 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTX3P26022 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTX3P26022 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTX3P26022 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTX3P26022 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTX3P26022 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
PTX3P26022 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTX3P26022 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTX3P26022 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTX3P26022 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTX3P26022 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTX3P26022 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTX3P26022 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTX3P26022 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTX3P26022 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTX3P26022 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTX3P26022 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTX3P26022 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTX3P26022 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTX3P26022 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTX3P26022 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTX3P26022 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTX3P26022 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTX3P26022 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTX3P26022 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTX3P26022 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTX3P26022 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTX3P26022 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTX3P26022 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTX3P26022 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTX3P26022 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTX3P26022 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTX3P26022 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTX3P26022 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTX3P26022 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTX3P26022 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTX3P26022 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTX3P26022 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTX3P26022 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTX3P26022 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTX3P26022 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTX3P26022 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTX3P26022 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTX3P26022 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTX3P26022 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTX3P26022 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTX3P26022 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms