Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms