Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCNE1P24864 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms