Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ERCC3P19447 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms