Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNNI3P19429 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNNI3P19429 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNNI3P19429 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNNI3P19429 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TNNI3P19429 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNNI3P19429 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNNI3P19429 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNNI3P19429 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNNI3P19429 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNNI3P19429 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms