Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCLP19338 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCLP19338 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCLP19338 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCLP19338 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCLP19338 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCLP19338 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCLP19338 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCLP19338 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCLP19338 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCLP19338 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCLP19338 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCLP19338 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NCLP19338 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCLP19338 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCLP19338 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCLP19338 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCLP19338 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCLP19338 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCLP19338 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCLP19338 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCLP19338 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCLP19338 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCLP19338 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NCLP19338 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCLP19338 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCLP19338 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NCLP19338 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NCLP19338 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NCLP19338 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCLP19338 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCLP19338 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCLP19338 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCLP19338 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCLP19338 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCLP19338 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCLP19338 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCLP19338 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCLP19338 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCLP19338 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCLP19338 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCLP19338 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NCLP19338 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCLP19338 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCLP19338 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCLP19338 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCLP19338 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCLP19338 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCLP19338 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCLP19338 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCLP19338 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCLP19338 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCLP19338 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLP19338 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLP19338 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLP19338 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLP19338 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLP19338 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLP19338 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLP19338 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLP19338 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLP19338 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLP19338 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLP19338 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLP19338 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLP19338 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLP19338 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLP19338 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLP19338 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLP19338 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLP19338 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLP19338 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLP19338 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLP19338 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLP19338 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLP19338 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLP19338 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLP19338 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLP19338 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLP19338 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLP19338 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCLP19338 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCLP19338 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCLP19338 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCLP19338 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCLP19338 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCLP19338 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCLP19338 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCLP19338 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCLP19338 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCLP19338 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCLP19338 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCLP19338 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCLP19338 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCLP19338 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NCLP19338 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NCLP19338 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NCLP19338 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCLP19338 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCLP19338 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms