Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATF3P18847 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATF3P18847 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATF3P18847 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATF3P18847 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATF3P18847 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATF3P18847 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATF3P18847 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATF3P18847 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATF3P18847 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATF3P18847 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATF3P18847 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATF3P18847 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATF3P18847 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATF3P18847 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ATF3P18847 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATF3P18847 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATF3P18847 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATF3P18847 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATF3P18847 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATF3P18847 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATF3P18847 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATF3P18847 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATF3P18847 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATF3P18847 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATF3P18847 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ATF3P18847 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ATF3P18847 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATF3P18847 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATF3P18847 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATF3P18847 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATF3P18847 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATF3P18847 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATF3P18847 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATF3P18847 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATF3P18847 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATF3P18847 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATF3P18847 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATF3P18847 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATF3P18847 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATF3P18847 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATF3P18847 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATF3P18847 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATF3P18847 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATF3P18847 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATF3P18847 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATF3P18847 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATF3P18847 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATF3P18847 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATF3P18847 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATF3P18847 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATF3P18847 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATF3P18847 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATF3P18847 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATF3P18847 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ATF3P18847 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATF3P18847 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATF3P18847 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATF3P18847 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATF3P18847 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATF3P18847 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF3P18847 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF3P18847 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF3P18847 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF3P18847 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF3P18847 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF3P18847 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF3P18847 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF3P18847 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF3P18847 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF3P18847 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF3P18847 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF3P18847 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF3P18847 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF3P18847 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF3P18847 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF3P18847 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF3P18847 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF3P18847 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF3P18847 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF3P18847 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF3P18847 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF3P18847 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF3P18847 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF3P18847 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF3P18847 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF3P18847 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF3P18847 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF3P18847 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF3P18847 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF3P18847 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF3P18847 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF3P18847 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF3P18847 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF3P18847 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF3P18847 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF3P18847 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ATF3P18847 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ATF3P18847 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATF3P18847 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms