Protein–RNA interactions for Protein: P17658

KCNA6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA6P17658 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNA6P17658 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNA6P17658 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms