Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN2P17655 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms