Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms