Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
VEGFAP15692 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFAP15692 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms