Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL5P13501 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL5P13501 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL5P13501 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL5P13501 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL5P13501 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL5P13501 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL5P13501 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL5P13501 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL5P13501 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL5P13501 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL5P13501 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL5P13501 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL5P13501 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL5P13501 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL5P13501 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL5P13501 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL5P13501 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL5P13501 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL5P13501 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL5P13501 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL5P13501 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL5P13501 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL5P13501 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL5P13501 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL5P13501 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL5P13501 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL5P13501 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL5P13501 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL5P13501 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL5P13501 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL5P13501 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL5P13501 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL5P13501 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL5P13501 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL5P13501 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL5P13501 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL5P13501 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL5P13501 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL5P13501 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL5P13501 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL5P13501 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL5P13501 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCL5P13501 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL5P13501 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL5P13501 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL5P13501 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL5P13501 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL5P13501 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL5P13501 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL5P13501 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL5P13501 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL5P13501 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL5P13501 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL5P13501 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL5P13501 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL5P13501 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL5P13501 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL5P13501 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL5P13501 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL5P13501 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL5P13501 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL5P13501 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL5P13501 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL5P13501 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL5P13501 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL5P13501 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL5P13501 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL5P13501 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL5P13501 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL5P13501 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL5P13501 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL5P13501 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL5P13501 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL5P13501 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL5P13501 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL5P13501 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL5P13501 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL5P13501 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL5P13501 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL5P13501 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL5P13501 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL5P13501 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL5P13501 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL5P13501 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL5P13501 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL5P13501 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL5P13501 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL5P13501 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL5P13501 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL5P13501 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL5P13501 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL5P13501 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL5P13501 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL5P13501 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL5P13501 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL5P13501 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL5P13501 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL5P13501 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL5P13501 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms