Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCF2P10911 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCF2P10911 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCF2P10911 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCF2P10911 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCF2P10911 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCF2P10911 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCF2P10911 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCF2P10911 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCF2P10911 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCF2P10911 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MCF2P10911 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCF2P10911 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCF2P10911 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2P10911 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2P10911 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2P10911 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2P10911 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2P10911 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2P10911 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2P10911 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2P10911 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2P10911 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2P10911 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2P10911 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2P10911 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2P10911 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2P10911 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2P10911 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2P10911 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2P10911 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2P10911 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2P10911 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2P10911 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2P10911 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2P10911 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2P10911 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2P10911 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2P10911 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2P10911 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCF2P10911 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCF2P10911 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCF2P10911 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCF2P10911 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCF2P10911 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCF2P10911 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCF2P10911 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCF2P10911 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCF2P10911 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MCF2P10911 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCF2P10911 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCF2P10911 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCF2P10911 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCF2P10911 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCF2P10911 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCF2P10911 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCF2P10911 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCF2P10911 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCF2P10911 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCF2P10911 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCF2P10911 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCF2P10911 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCF2P10911 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCF2P10911 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCF2P10911 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MCF2P10911 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCF2P10911 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MCF2P10911 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCF2P10911 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCF2P10911 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCF2P10911 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MCF2P10911 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MCF2P10911 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MCF2P10911 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MCF2P10911 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCF2P10911 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCF2P10911 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCF2P10911 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MCF2P10911 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCF2P10911 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MCF2P10911 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCF2P10911 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCF2P10911 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCF2P10911 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCF2P10911 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MCF2P10911 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCF2P10911 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCF2P10911 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCF2P10911 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MCF2P10911 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCF2P10911 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCF2P10911 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCF2P10911 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCF2P10911 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCF2P10911 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCF2P10911 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCF2P10911 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCF2P10911 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCF2P10911 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCF2P10911 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms