Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
U2AF1L5P0DN76 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms