Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD2P0DJD1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms