Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SFTA3P0C7M3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms