Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CT47B1P0C2W7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
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