Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXB7P09629 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms