Protein–RNA interactions for Protein: P09341

CXCL1, Growth-regulated alpha protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL1P09341 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL1P09341 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms