Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP10P09238 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP10P09238 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP10P09238 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP10P09238 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP10P09238 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP10P09238 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP10P09238 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP10P09238 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP10P09238 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP10P09238 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP10P09238 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP10P09238 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP10P09238 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP10P09238 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP10P09238 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP10P09238 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP10P09238 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP10P09238 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP10P09238 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP10P09238 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP10P09238 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP10P09238 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP10P09238 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP10P09238 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP10P09238 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP10P09238 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP10P09238 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP10P09238 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP10P09238 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP10P09238 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP10P09238 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP10P09238 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP10P09238 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP10P09238 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP10P09238 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP10P09238 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP10P09238 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP10P09238 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP10P09238 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP10P09238 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP10P09238 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP10P09238 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP10P09238 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP10P09238 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP10P09238 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP10P09238 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP10P09238 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP10P09238 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP10P09238 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP10P09238 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP10P09238 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP10P09238 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP10P09238 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP10P09238 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP10P09238 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP10P09238 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP10P09238 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP10P09238 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP10P09238 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP10P09238 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP10P09238 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP10P09238 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP10P09238 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP10P09238 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP10P09238 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP10P09238 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP10P09238 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP10P09238 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP10P09238 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP10P09238 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP10P09238 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP10P09238 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP10P09238 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP10P09238 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP10P09238 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP10P09238 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP10P09238 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP10P09238 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP10P09238 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP10P09238 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP10P09238 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP10P09238 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP10P09238 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP10P09238 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP10P09238 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP10P09238 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP10P09238 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP10P09238 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP10P09238 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP10P09238 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP10P09238 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP10P09238 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP10P09238 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP10P09238 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP10P09238 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP10P09238 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP10P09238 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP10P09238 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP10P09238 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms