Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NGFRP08138 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NGFRP08138 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NGFRP08138 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NGFRP08138 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NGFRP08138 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NGFRP08138 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NGFRP08138 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NGFRP08138 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NGFRP08138 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NGFRP08138 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NGFRP08138 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NGFRP08138 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NGFRP08138 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NGFRP08138 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NGFRP08138 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NGFRP08138 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NGFRP08138 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NGFRP08138 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NGFRP08138 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NGFRP08138 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NGFRP08138 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NGFRP08138 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NGFRP08138 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NGFRP08138 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NGFRP08138 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NGFRP08138 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NGFRP08138 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NGFRP08138 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NGFRP08138 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NGFRP08138 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NGFRP08138 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NGFRP08138 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NGFRP08138 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NGFRP08138 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NGFRP08138 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NGFRP08138 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NGFRP08138 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NGFRP08138 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NGFRP08138 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NGFRP08138 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NGFRP08138 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NGFRP08138 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NGFRP08138 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NGFRP08138 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NGFRP08138 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NGFRP08138 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NGFRP08138 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NGFRP08138 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NGFRP08138 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NGFRP08138 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NGFRP08138 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NGFRP08138 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NGFRP08138 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NGFRP08138 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NGFRP08138 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NGFRP08138 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NGFRP08138 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NGFRP08138 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NGFRP08138 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NGFRP08138 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NGFRP08138 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NGFRP08138 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NGFRP08138 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NGFRP08138 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NGFRP08138 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NGFRP08138 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NGFRP08138 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NGFRP08138 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NGFRP08138 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NGFRP08138 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NGFRP08138 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NGFRP08138 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NGFRP08138 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NGFRP08138 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NGFRP08138 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NGFRP08138 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NGFRP08138 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NGFRP08138 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NGFRP08138 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NGFRP08138 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NGFRP08138 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NGFRP08138 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NGFRP08138 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NGFRP08138 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NGFRP08138 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NGFRP08138 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NGFRP08138 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NGFRP08138 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NGFRP08138 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NGFRP08138 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NGFRP08138 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NGFRP08138 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NGFRP08138 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NGFRP08138 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NGFRP08138 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NGFRP08138 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NGFRP08138 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NGFRP08138 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NGFRP08138 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms