Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGAVP06756 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms