Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGB3P05106 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGB3P05106 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGB3P05106 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGB3P05106 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGB3P05106 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGB3P05106 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGB3P05106 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGB3P05106 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGB3P05106 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB3P05106 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB3P05106 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB3P05106 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB3P05106 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB3P05106 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB3P05106 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB3P05106 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB3P05106 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB3P05106 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB3P05106 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB3P05106 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB3P05106 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB3P05106 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB3P05106 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB3P05106 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB3P05106 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB3P05106 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB3P05106 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB3P05106 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB3P05106 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3P05106 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3P05106 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3P05106 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3P05106 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3P05106 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3P05106 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3P05106 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3P05106 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3P05106 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3P05106 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3P05106 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3P05106 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3P05106 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3P05106 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3P05106 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3P05106 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3P05106 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms