Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD2O96028 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD2O96028 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD2O96028 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD2O96028 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD2O96028 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD2O96028 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD2O96028 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD2O96028 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD2O96028 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD2O96028 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD2O96028 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD2O96028 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD2O96028 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD2O96028 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD2O96028 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD2O96028 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD2O96028 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD2O96028 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD2O96028 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD2O96028 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD2O96028 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD2O96028 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSD2O96028 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSD2O96028 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSD2O96028 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSD2O96028 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NSD2O96028 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NSD2O96028 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NSD2O96028 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NSD2O96028 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NSD2O96028 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
NSD2O96028 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD2O96028 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD2O96028 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD2O96028 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD2O96028 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD2O96028 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD2O96028 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD2O96028 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD2O96028 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD2O96028 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD2O96028 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD2O96028 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD2O96028 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD2O96028 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD2O96028 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD2O96028 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD2O96028 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD2O96028 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD2O96028 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD2O96028 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD2O96028 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD2O96028 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD2O96028 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD2O96028 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD2O96028 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD2O96028 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD2O96028 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD2O96028 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD2O96028 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD2O96028 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD2O96028 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD2O96028 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD2O96028 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD2O96028 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD2O96028 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD2O96028 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD2O96028 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD2O96028 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD2O96028 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD2O96028 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD2O96028 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD2O96028 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD2O96028 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD2O96028 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD2O96028 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD2O96028 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD2O96028 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD2O96028 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD2O96028 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD2O96028 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD2O96028 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD2O96028 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD2O96028 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD2O96028 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD2O96028 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD2O96028 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD2O96028 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD2O96028 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD2O96028 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD2O96028 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD2O96028 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD2O96028 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD2O96028 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSD2O96028 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSD2O96028 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSD2O96028 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSD2O96028 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSD2O96028 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms